Em Anaconda 3, a ação se passa na Romênia, onde um grupo de mercenários é incumbido de ajudar uma bela cientista na captura de uma cobra alterada geneticamente e cujo veneno pode ser a chave para a cura de doenças. O problema é que, além do animal ser muito maior e mais selvagem que qualquer outro de sua espécie, ainda conta com um ferrão afiadíssimo em sua causa.